Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snx9Q91VH2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx9Q91VH2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms