Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cacng5Q8VHW4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms