Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mark1Q8VHJ5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mark1Q8VHJ5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mark1Q8VHJ5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mark1Q8VHJ5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mark1Q8VHJ5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mark1Q8VHJ5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mark1Q8VHJ5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms