Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SelenomQ8VHC3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SelenomQ8VHC3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms