Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vps4aQ8VEJ9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vps4aQ8VEJ9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms