Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Dkk4Q8VEJ3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Dkk4Q8VEJ3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms