Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc71Q8VEG0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc71Q8VEG0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms