Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Srsf4Q8VE97 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Srsf4Q8VE97 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms