Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cul7Q8VE73 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cul7Q8VE73 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms