Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn4Q8VCH8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn4Q8VCH8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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