Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCA5

Tmprss4, Transmembrane protease serine 4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss4Q8VCA5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmprss4Q8VCA5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms