Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc9a8Q8R4D1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms