Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mterf3Q8R3J4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mterf3Q8R3J4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms