Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ClmpQ8R373 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClmpQ8R373 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ClmpQ8R373 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmpQ8R373 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmpQ8R373 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmpQ8R373 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmpQ8R373 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmpQ8R373 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmpQ8R373 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmpQ8R373 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmpQ8R373 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ClmpQ8R373 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms