Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r200Q8R281 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Vmn1r200Q8R281 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Vmn1r200Q8R281 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Vmn1r200Q8R281 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r200Q8R281 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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