Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2f2Q8R0A0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2f2Q8R0A0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms