Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4N3

Defb12, Beta-defensin 12, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb12Q8K4N3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Defb12Q8K4N3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Defb12Q8K4N3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms