Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J2

Ebf4, Transcription factor COE4, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf4Q8K4J2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ebf4Q8K4J2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ebf4Q8K4J2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms