Protein–RNA interactions for Protein: Q8K441

Abca6, ATP-binding cassette sub-family A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca6Q8K441 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Abca6Q8K441 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Abca6Q8K441 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Abca6Q8K441 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms