Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r72Q8K3N7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r72Q8K3N7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms