Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ncapd2Q8K2Z4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms