Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prpf39Q8K2Z2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prpf39Q8K2Z2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms