Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccm2Q8K2Y9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms