Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Trappc12Q8K2L8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trappc12Q8K2L8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms