Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms