Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R3

Pnpt1, Polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpt1Q8K1R3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pnpt1Q8K1R3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pnpt1Q8K1R3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms