Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sde2Q8K1J5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms