Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FgbQ8K0E8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms