Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrit1Q8K099 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrit1Q8K099 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrit1Q8K099 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms