Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Afg3l2Q8JZQ2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Afg3l2Q8JZQ2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms