Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Snx8Q8CFD4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms