Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pramef8Q8CE24 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pramef8Q8CE24 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pramef8Q8CE24 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pramef8Q8CE24 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Pramef8Q8CE24 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pramef8Q8CE24 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pramef8Q8CE24 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pramef8Q8CE24 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Pramef8Q8CE24 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pramef8Q8CE24 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pramef8Q8CE24 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms