Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
9030612E09RikQ8CE20 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
9030612E09RikQ8CE20 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms