Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc87Q8CDL9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc87Q8CDL9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms