Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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