Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nrip1Q8CBD1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nrip1Q8CBD1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms