Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc159Q8C963 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc159Q8C963 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms