Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
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Col6a6Q8C6K9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a6Q8C6K9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col6a6Q8C6K9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a6Q8C6K9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a6Q8C6K9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a6Q8C6K9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a6Q8C6K9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col6a6Q8C6K9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Col6a6Q8C6K9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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