Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Ubqln3Q8C5U9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ubqln3Q8C5U9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ubqln3Q8C5U9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ubqln3Q8C5U9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ubqln3Q8C5U9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubqln3Q8C5U9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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