Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sfrp1Q8C4U3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms