Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rft1Q8C3B8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms