Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn17Q8BXA6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn17Q8BXA6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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