Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Ube3dQ8BX13 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ube3dQ8BX13 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ube3dQ8BX13 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ube3dQ8BX13 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ube3dQ8BX13 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Ube3dQ8BX13 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ube3dQ8BX13 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ube3dQ8BX13 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ube3dQ8BX13 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Ube3dQ8BX13 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ube3dQ8BX13 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ube3dQ8BX13 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Ube3dQ8BX13 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Ube3dQ8BX13 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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