Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TtpaQ8BWP5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms