Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Usp38Q8BW70 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
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Usp38Q8BW70 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp38Q8BW70 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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