Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pggt1bQ8BUY9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pggt1bQ8BUY9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms