Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUJ9

Lrp12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp12Q8BUJ9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrp12Q8BUJ9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrp12Q8BUJ9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms