Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pbrm1Q8BSQ9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pbrm1Q8BSQ9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms