Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Prpf18Q8BM39 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prpf18Q8BM39 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Prpf18Q8BM39 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Prpf18Q8BM39 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prpf18Q8BM39 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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