Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpc2Q8BKV1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc2Q8BKV1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc2Q8BKV1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms